名古屋市立大学始建于1884年,名古屋药学校。1950年4月,将名古屋女子医科大学和名古屋药科大学合并,成立了拥有医学系(旧制)和药学系(新制)两个系的名古屋市立大学。此后,经过各种修改,于2006年4月1日,决定重新成立公立大学法人名古屋市立大学。